豚が持つウイルスが、コガタアカイエカ（水田等に発生する種類の蚊）を媒介として人へ感染します。7～10日間の潜伏期間があります。症状としては、数日間、高熱、頭痛、嘔吐などが起こり、次に光への過敏症、意識障害（意識がなくなる）、神経系障害（脳の障害）が起こります。 北海道を除く日本全国に、日本脳炎ウイルスを媒介する蚊がいます。西日本を中心に、年に10人ほど発症しているという報告があります。

ウイルスに感染しても、症状が出ないまま過ぎることがほとんどですが、発症すると、、約１５％が死亡に至るといわれ、幼少児は危険です。3、4歳頃予防接種が受けられますが、日本脳炎の予防接種で副作用が出る場合が報告され、現在は積極的な推奨はなされていません。しかし、発症した場合の有効な治療法がないため予防しておいたほうがよいかもしれません。、東アジア・南アジアにおいては感染の可能性がある病気です。

日本脳炎ワクチンの副反応に、重い症状は余りありませんが、まれに発熱や接種部位の腫れ、発疹などが出ることがあります。

接種する時期としては、初回接種は、Ⅰ期として、生後6～90ヶ月に、1～4週間開けて2回接種します。その後、9～15歳をⅡ期として、追加接種を2回、4～5年間隔で受けます。